GÉNOMIQUE ET ANALYSE MOLÉCULAIRE DE LA PATHOGÉNIE DES BACTÉRIES PHYTOPATHOGÈNES
UMR 385 BGPI
Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite
- Organismes de tutelle : CIRAD-INRA-Université de Montpellier-SupAgro
- DU : Claire NEEMA (04 99 62 48 69)
- Site web: https://umr-bgpi.cirad.fr
- Centre : Montpellier – Campus de Baillarguet
- Localisation : CIRAD Campus International de Baillarguet– TA A-54/K, 34398 Montpellier Cedex 5
- Contact site IMH : N/A
Animateur(s)
〉ROYER Monique(Chercheur, CIRAD) 04 99 62 48 44
〉COCIANCICH Stéphane(Chercheur, CIRAD) 04 99 62 48 15
Composition équipe
Chercheurs
〉 COCIANCICH Stéphane
〉 PIERETTI Isabelle
〉 ROYER Monique
Thésards
〉 SABRI Souhir
Thématique
Thématique de recherche: Découvrir et étudier de nouvelles petites molécules chez les bactéries phytopathogènes.
Le modèle d’étude est Xanthomonas albilineans, l’agent causal de l’échaudure des feuilles de la canne à sucre. Le séquençage, l’annotation et l’analyse du génome de X. albilineans ont permis de confirmer que le pathosystème canne à sucre-X. albilineans constitue un modèle particulier et original au sein de la famille des Xanthomonadaceae.
Le projet de recherche est l’étude des facteurs de pathogénie qui permettent à X. albilineans de se multiplier efficacement dans le xylème de la canne à sucre et de provoquer la maladie.
Dans ce but, les recherches réalisées par l’équipe font appel à trois approches complémentaires :
• la biochimie : analyse structurale et fonctionnelle de petites molécules synthétisées par la voie NRPS («non-ribosomal peptide synthesis»),
• la génomique comparative : l’analyse in silico du génome de différentes souches de X. albilineans,
• la génomique fonctionnelle : l’analyse fonctionnelle de gènes de pathogénie candidats.
Couple microorganisme-hôte
Canne à sucre/Xanthomonas albilineans – plantes hôtes/bactéries phytopathogène
Organismes étudiés
canne à sucre, Xanthomonas
Mots clés techniques
biochimie, biologie moléculaire, phytopathologie
Travaux de terrain
non
Outils communs
N/A
Thèses en cours
La biosynthèse non ribosomique chez les Xanthomonas
Principales publications
- Cociancich S., Pesic A., Petras D., Uhlmann S, Kretz J., Schubert V., Vieweg L., Duplan S., Marguerettaz M., Noëll J., Pieretti I., Hügelland M., Kemper S., Mainz A., Rott P., Royer M., Süssmuth R.D. (2015) The gyrase inhibitor albicidin consists of p-aminobenzoic acids and cyanoalanine. Nature Chemical Biology 11, 195-197.
- Kretz J., Kerwat D., Schubert S., Grätz S., Pesic A., Semsary S., Cociancich S., Royer M., Süssmuth R.D. (2015) Total synthesis of albicidin: a lead structure from Xanthomonas albilineans for potent antibacterial gyrase inhibitors. Angewandte Chemie International Edition 54, 1969-1973.
- Vieweg L., Kretz J., Pesic A., Kerwat D., Grätz S., Royer M., Cociancich S., Mainz A., Süssmuth R.D. (2015) The albicidin resistance factor AlbD is a serine endopeptidase that hydrolyzes unusual oligoaromatic-type peptides. Journal of the American Chemical Society 137, 7608-7611.
- Pieretti I., Pesic A., Petras D., Royer M., Süssmuth R.D., Cociancich S. (2015) What makes Xanthomonas albilineans unique amongst Xanthomonads? Frontiers in Plant Science 6, 289
- Royer M., Koebnik R., Marguerettaz M., Barbe V., Robin G.P., Brin C., Carrere S., Gomez C.,Hügelland M., Völler G.H., Noëll J., Pieretti I., Rausch S., Verdier V., Poussier S., Rott P., Süssmuth R.D. and Cociancich S. (2013) Genome mining reveals the genus Xanthomonas to be a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. BMC Genomics 14, 658
Collaborations
- Université Technique de Berlin (Prof. Roderich Süssmuth)
- UMR IRHS (Dr Marie-Agnès Jacques, Angers)
- UMR LIPM (Prof. Mathieu Arlat, Toulouse)
- UMR IPME (Dr Ralf Koebnik, Montpellier)